病毒很小。多数单个病毒粒子的直径在100nm左右，也就是说，把10万个左右的病毒粒子排列起来才可能用肉眼委曲看得到。
病毒如此渺小，尽大多数病毒必需借助电子显微镜才干察看，电子显微镜的辨别率是光学显微镜的1000倍。不同病毒间大小差别很大。Zui小的如植物的联体病毒（Geminiviruses）直径仅18-20nm，Zui大的动物痘病毒（Poxviruses）大小达300-450nm×170-260nm，Zui长的如丝状病毒科（Filoviridae）病毒粒子大小为80nm×790-14000nm。
光学显微镜的辨别间隔为d=0.61λ/NA 式中
d——物镜的分辩间隔，单位 nm。
λ——照明光线波长，单位 nm。
NA ——物镜的数值孔径
例如油浸物镜的数值孔径为1.25，可见光波长范畴为400—700nm ，取其均匀波长550 nm，则d=270 nm，约即是照明光线波长一半。一般地，用可见光照明的显微镜辨别力的极限是0.2μm也就是200nm，大于病毒的直径，因此用光学显微镜是看不到病毒的。
细菌就比病毒大得多，单个球菌的直径约在0.8～1.2μm左右，大多数杆菌中等大小长2～5μm，宽0.3～1μm，在光学显微镜的可观测范畴内。
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