光学显微镜有多种分类方式：按应用目镜的数目可分为双目和单目显微镜
双目体视显微镜是应用双通道光路，为左右两眼供给一个具有立体感的图像。它本质上是两个单镜筒显微镜并列放置，两个镜筒的光轴构成相当于人们用双目察看一个物体时所形成的视角，以此形成三维空间的立体视觉图像。双目体视显微镜在生物、医学范畴普遍用于切片操作和显微外科手术；在产业中用于渺小零件和集成电路的观测、装配、检讨等工作。
三目显微镜除了双眼察看用的两目，还有一目是用来外接电脑或者数码相机，也就组成了电脑型xx（生物/金相……）显微镜和数码型xx显微镜
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